这3个lncRNA组成的食管癌诊断分类器

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最近看到某公司宣传他们的产品,是lncRNA的芯片,文章是发表的,研究思路很清晰:个食管癌病人的肿瘤组织和配对样品的lncRNA芯片数据,在GSE芯片平台比较老旧了,是AgilenthumanlncRNA+mRNAarrayV.2.0把个食管癌病人数据拆分成为training(n=60)andtest(n=59)数据集在训练集里面,筛选lncRNAs表达量有变化的,然后差异分析得到个有表达差异的lncRNAs。然后随机森林,筛选9个跟生存最相关的,然后排列组合,定下来3个lncRNAs。寻找3个lncRNAs所调控的蛋白编码基因并且进行注释。看起来似乎是Agilent和CBC公司合作,所以芯片平台是:Agilent-CBCHomosapienslncRNA+mRNAmicroarrayV2.0(FeatureNumberversion),从有表达差异的基因列表里面筛选到最后的3个lncRNA组成的食管癌诊断分类器基因集,过程比较复杂,如下:筛选基因有趣的是,这篇文章的数据非常多,还有个:

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