今天,所有的生物学都是计算生物学

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今天所有的生物学已经成为了计算生物学。计算生物学带来了我们对生命的理解，它使生物学概念变得严格和可测试，它提供了一个参考范本，可以规范个人对生物学的见解。英国剑桥大学的FlorianMarkowetz在《PlosBiology》发文称，他认为，今天的生物学，就是计算生物学。现将该文翻译现整理如下。生物学就是计算生物学FlorianMarkowetz英国剑桥大学，剑桥研究院摘要

在这里，我认为计算思维和技术成为了追求理解生活的核心，今天所有的生物学已经成为了计算生物学。计算生物学带来了我们对生命的理解，它使生物学概念变得严格和可测试，它提供了一个参考范本，可以规范个人对生物学的见解。生物学中的下一个重大进化将由数学、统计和计算方法驱动，需要被吸收到主流生物培训中，将生物学转变为定量科学。

正文FlorianMarkowetz“像你这样的人，是怎么能够成为通讯作者，并发表文章的呢？”一位业界领先的细胞生物学家，在我年申请当前这个工作的面试中，问了我这个问题，这意味着我永远不能在研究项目中担任高级角色。我曾经接受过数学和机器学习的科学训练，但却正在面试一个癌症研究所的计算生物学工作。我的面试官们，不太确定我未来对生物学的贡献是什么。不是做计算的人只是服务的提供者么？这个社会做计算的人一抓一大把，但往往并没有任何真正的科学视野？她显然担心我是否能做独立的生物研究。她不是最后一个担心我的。在年，在发表了几篇通讯作者的文章后，我被列入欧洲分子生物组织年轻研究员奖学金的入围者，但最后没有得到。面试小组提供的反馈称，我们的组是“数学服务单位”，声称“缺乏对生物学的深入理解”，并且声称“对合作者过度依赖”。

去年，我们终于看到计算工作的真正意义，当《新英格兰医学杂志》的主编使用术语“研究寄生虫”来描述计算生物学家有意义的发表数据时，我感到了无比的失望。哈~

在过去20年中，计算方法已经成为生物学的一个成熟的部分，但上述例子表明，“老派”的或者“传统的”生物学家和临床医生，也正好是那些可以做出决定什么文章可以发表的人，以及生物学资金流向和职业发布的人，继续对像我这种没有接受传统生物学的“科班培训”的人感到不爽。那些明明在其他领域混饭吃的人，现在却挤进了生物学领域，开始使用些老牌生物学家们从未学过的方法，来搞生物学研究。如果，即使我的生命科学领域的同事也不明白为什么生物计算研究是重要的，难道没有任何其他人都能看到它的价值吗？

在下面，我将提出我的论断，计算思维和计算方法对于理解生命的追求至关重要，今天，所有的生物学都是计算生物学。

计算生物学带来了我们对生活的理解

HallamStevens对计算生物学的人种学和历史描述中提到（《LifeOutofSequence》），“生物学应该适应计算机，而不是反过来”。他解释说：“计算机不只是扩大老的生物学领域，他们还带来了完全新的工具和问题，如统计，模拟和数据管理，完全重塑了生物研究的方式。”

计算机重塑生物研究的一个关键例子，是使用数据库和本体（信息科学术语）。今天的生物学知识，通过计算被定义，组织和访问。如果瑞典植物学家和分类学之父CarlvonLinné（也被称为CarlLinnaeus，卡尔林奈）活在今天，他将是一个计算生物学家。作为植物学家，他可能在像transPLANT（

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