癌症基因检测样本量不够失败率高
日前,美国IntermountainHealthcare公司发布了一项名为ICGoncoFocusPanel的最新基因检测产品。该产品基于核酸质谱技术,可利用少量组织样本对癌症患者进行五种致癌基因的检测,在个体化治疗的同时,还可显著降低检测失败率。据悉,该产品所检测的五个基因包括KRAS、BRAF、NRAS、EGFR和KIT。这些基因突变通常属于肺癌、黑素瘤和结肠癌患者中的常见突变,并且能够作为靶点通过已上市的药物进行靶向治疗。研究人员表示,该panel基于AgenaBioscience公司的MassARRAY系统开发,相比大型的NGSpanel,其规模较小,价格更低,所以其更容易获得保险公司的报销。
四年前,Intermountain公司曾开发了一款包括个基因的panel(ICGComprehensiveCancerPanel),并为IV期癌症转移患者提供基因组分析服务。这家总部位于盐湖城的诊断服务公司最近将该panel的检测范围扩大到了个与癌症通路相关的基因。
据了解,IntermountainHealthcare公司的基因组测序服务由IntermountainPrecisionGenomics公司提供。其中心实验室经理DavidLoughmiller表示,ICGComprehensiveCancerPanel可评估约4,个SNP、大/小片段插入缺失以及拷贝数变异,但是检测需要约ngDNA。相较之下,新上市的这款产品ICGoncoFocusPanel可以检测约个SNP及插入缺失,虽然并不能检测拷贝数变异,但仅需20ngDNA或5~8个细胞(其中40%必须为癌细胞)。Loughmiller说:“长久以来,我们收到的主要为通过介入放射性针刺活检获得的极少量样本,因此我们希望能够减少大型panel使用过程中遇到的样本量不足的状况。”一直以来,使用大型panel检测时,约有18%的患者存在样本量不足的问题。Loughmiller表示,使用这款定制的小型panel,实验室能够将由样本量不足导至的检测失败率减少80%。他估计,只有3.6%的检测会失败。“这对于我们非常重要,这样就可以利用少量的样本给患者进行分析。”Loughmiller说,“即使我们无法进行大型panel的检测,但至少能够对我们白癜风可以医治吗北京哪家治白癜风能治好吗
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