GenomeMedicine可进行癌症
肿瘤或者各类遗传性疾病中,结构变异(StructuralVariants,SVs)是极为重要的变异类型,在疾病发生、发展和治疗的监测过程中,都有一定的意义。在对肿瘤样品进行动态监测时,采用外周血样品进行循环肿瘤DNA(circulatingtumorDNA,ctDNA)检测,被认为是最直接简便且有效的方式之一。
年5月,来自荷兰伊拉斯谟癌症研究所和乌德勒支大学的几位研究者(JoseEspejoValle-Inclan和ChristinaStangl等),在GenomeMedicine(IF=11.1)杂志上,发表了题为“OptimizingNanoporesequencing-baseddetectionofstructuralvariantsenablesindividualizedcirculatingtumorDNA-baseddiseasemonitoringincancerpatients”的文章,该项研究基于Nanopore长读长测序技术和独特的SHARC分析流程,鉴定了独有的SVs,开发了检测ctDNA中的相关SVs作为癌症病人监测的技术流程。
在该研究中,研究者基于Nanopore的低深度全基因组测序技术和一种结构变异(SVs)检测/筛选分析流程SHARC(
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